廣州恒大時期

2012年7月7日廣州恒大正式宣布和黃博文簽約 。黃博文代表廣州恒大俱樂部征戰(zhàn)中超和亞冠聯(lián)賽。黃博文的加盟也令恒大俱樂部的國腳數量正好達到11人。
2012年9月20日，在亞冠聯(lián)賽1/4決賽首回合對決中，中超冠軍廣州恒大客場挑戰(zhàn)兩屆亞冠得主沙特伊蒂哈德隊，比賽進行到第39分鐘，恒大制造威脅，巴里奧斯頭球擊中橫梁，孔卡禁區(qū)內回做，黃博文首次觸球就勁射破門。
2013年5月29日20點，中超聯(lián)賽第4輪的一場補賽在廣州天河體育場打響，廣州恒大主場迎戰(zhàn)貴州人和。比賽進行到第73分鐘，埃爾克森弧頂左側任意球重炮轟門，張烈側撲將球擋出，黃博文小禁區(qū)右側跟進補射建功。第90分鐘，黃博文弧頂前沿教科書般任意球直接破門，廣州恒大將比分鎖定為4-0。這也是黃博文職業(yè)生涯第一次梅開二度。
2013年7月8日,中國足協(xié)公布了參加東亞四強賽的23人名單, 黃博文再次入選國家隊
2013年11月9日，代表廣州恒大奪得2013年賽季亞洲冠軍聯(lián)賽冠軍
2013年11月27日晚，2013中國足協(xié)杯半決賽廣州恒大主場對北京國安的次回合較量展開。本場比賽堪稱經典，恒大率先打入2球，幾乎殺死了比賽，然而國安并不甘心失敗，不利形勢下他們竟將比分扳成了3-3，只要再打入一球就能淘汰恒大。這時國安舊將黃博文挺身而出，打入恒大第4粒進球，提前殺死了懸念，進球后的黃博文也表達了自己對老東家的尊敬，并沒有慶祝。      

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