1890年(光緒十六年)
    夏末  衛(wèi)河先后于臨清胡家灣、張家窯及館陶馬頭等處決口。
    秋初  黃河水倒灌入運河，運河護堤多處被沖毀。

1891年(光緒十七年)    
    八月  臨清境內遭受蟲災。
    本年  聊城書業(yè)德書店創(chuàng)立，是為境內木版印刷之始。

1892年(光緒十八年)
    十二月  壽張人楊木、鄭顯之等聚眾起義，遭山東巡撫福潤鎮(zhèn)壓，楊木被捕，鄭顯之遭追捕。

1893年(光緒十九年)
    六月  黃河于東阿小生莊、陽谷陶城鋪等處決口；衛(wèi)河在冠縣境內決口，境內村莊半數(shù)被淹。
    本年  陽谷境內耕牛災疫流行，病、死者極多。
     Δ四川松潘人洪用舟任東昌府知府。

1894年(光緒二十年)
    本年  聊城縣建立公立錢局，承辦征收田賦、稅款、零星存儲和整批上繳等業(yè)務。

1895年(光緒二十一年)
    秋  黃河漫決，衛(wèi)運河漲溢，沿河村莊多被淹沒。
    本年  疏浚陽谷陶城鋪至臨清運河段100多公里。

1896年(光緒二十二年)
    本年  聊城縣知縣凌芬在城內義學舊宅改建攝西書院。       

1897年(光緒二十三年)
    三月十六日   冠縣梨園屯村民閻書勤等人反對外國傳教士在本村改廟建堂，率梅花拳民攻打教堂，打死教民1人，驅逐教民20余家，并拆毀教堂，重新蓋起玉皇廟。事后，東昌知府洪用舟即赴冠縣查辦，閻書勤等被迫逃至外地。

1898年(光緒二十四年)
    六月  黃河在東阿縣王家坡民埝決口，聊城、茌平兩縣一片汪洋。    
    Δ  朱紅燈率領義和拳拳民在茌平等地反對外國教會侵入。    
     八月  威縣義和拳首領趙三多統(tǒng)率各路拳民在冠縣蔣家莊馬場祭旗起事提出“滅洋”口號，發(fā)動反帝愛國斗爭。
     十一月三日  冠縣紅桃園拳民焚毀紅桃園、小李固等處教堂及教民房舍60多間，殺死教民2人、傷1人。        
     十一月四日  駐直隸、山東清軍鎮(zhèn)壓在兩省交界處活動的義和拳，4名拳民不幸犧牲，拳民首領姚洛奇等15人被捕。
    本年  冠縣梨園屯閻書勤組織義和拳，提出“扶清滅洋，殺盡天主教”的口號。他們轉戰(zhàn)臨清、聊城、曹州、濟南等地。   
     Δ     聊城考院撤銷。    
     Δ    江南江都人劉壩任東昌府知府。1899年(光緒二十五年)
    春  朱紅燈在茌平設拳場800余處，并提出“先學義和拳，后學紅燈照，殺了洋鬼子，滅了天主教”的口號，先后焚毀梁莊、王相莊、八里莊等處教堂。
十月十八日  朱紅燈率領茌平義和團援救平原縣拳民，與清軍戰(zhàn)于平原縣森羅殿，清軍死3人、傷10多人。
    十一月十四日  朱紅燈和高唐拳民首領心誠和尚率團圍攻張莊天主教堂。次日，將教堂焚燒。之后，義和團被清軍包圍，朱紅燈于二十一日在博平縣五里莊被捕，二十三日心誠和尚在高唐楊莊被捕，十二月二十四日在濟南同時被山東巡撫毓賢殺害。
    十一月二十八日    義和團首領王立言等率領高唐義和團百余人攻打禹城韓莊教堂，未克。繼之，屯軍伏擊高唐州李聯(lián)奎所率清軍。后被知州李恩祥鎮(zhèn)壓。
    本年  安徽黃山人王樂修任東昌府知府。